Protein–RNA interactions for Protein: P18031

PTPN1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN1P18031 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PTPN1P18031 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPN1P18031 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPN1P18031 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPN1P18031 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPN1P18031 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPN1P18031 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPN1P18031 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPN1P18031 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPN1P18031 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPN1P18031 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPN1P18031 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPN1P18031 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPN1P18031 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPN1P18031 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPN1P18031 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPN1P18031 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPN1P18031 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPN1P18031 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPN1P18031 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPN1P18031 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPN1P18031 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPN1P18031 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPN1P18031 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPN1P18031 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPN1P18031 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPN1P18031 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPN1P18031 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPN1P18031 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPN1P18031 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPN1P18031 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms