Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXD8P13378 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms