Protein–RNA interactions for Protein: P12004

PCNA, Proliferating cell nuclear antigen, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNAP12004 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCNAP12004 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCNAP12004 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCNAP12004 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCNAP12004 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCNAP12004 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCNAP12004 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCNAP12004 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCNAP12004 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCNAP12004 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCNAP12004 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCNAP12004 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCNAP12004 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCNAP12004 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCNAP12004 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCNAP12004 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCNAP12004 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCNAP12004 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCNAP12004 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCNAP12004 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCNAP12004 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCNAP12004 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCNAP12004 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCNAP12004 CCR7-201ENST00000246657 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCNAP12004 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCNAP12004 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCNAP12004 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCNAP12004 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCNAP12004 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
PCNAP12004 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCNAP12004 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCNAP12004 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCNAP12004 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCNAP12004 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCNAP12004 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCNAP12004 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCNAP12004 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCNAP12004 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCNAP12004 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCNAP12004 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCNAP12004 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCNAP12004 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCNAP12004 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCNAP12004 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCNAP12004 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCNAP12004 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
PCNAP12004 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCNAP12004 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCNAP12004 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCNAP12004 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCNAP12004 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCNAP12004 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCNAP12004 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCNAP12004 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCNAP12004 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCNAP12004 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCNAP12004 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCNAP12004 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCNAP12004 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCNAP12004 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCNAP12004 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCNAP12004 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PCNAP12004 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
PCNAP12004 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PCNAP12004 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PCNAP12004 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PCNAP12004 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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PCNAP12004 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PCNAP12004 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PCNAP12004 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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PCNAP12004 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PCNAP12004 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PCNAP12004 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PCNAP12004 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PCNAP12004 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PCNAP12004 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PCNAP12004 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PCNAP12004 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PCNAP12004 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PCNAP12004 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PCNAP12004 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PCNAP12004 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PCNAP12004 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PCNAP12004 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
PCNAP12004 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
PCNAP12004 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PCNAP12004 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PCNAP12004 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PCNAP12004 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PCNAP12004 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PCNAP12004 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
PCNAP12004 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PCNAP12004 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PCNAP12004 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
PCNAP12004 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
PCNAP12004 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PCNAP12004 HNF1B-204ENST00000617811 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PCNAP12004 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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