Protein–RNA interactions for Protein: O60488

ACSL4, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 4, humanhuman

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Length 711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSL4O60488 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACSL4O60488 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACSL4O60488 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACSL4O60488 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACSL4O60488 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACSL4O60488 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACSL4O60488 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACSL4O60488 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACSL4O60488 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACSL4O60488 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACSL4O60488 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACSL4O60488 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACSL4O60488 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACSL4O60488 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACSL4O60488 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACSL4O60488 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACSL4O60488 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACSL4O60488 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACSL4O60488 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACSL4O60488 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACSL4O60488 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ACSL4O60488 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACSL4O60488 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACSL4O60488 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACSL4O60488 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACSL4O60488 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACSL4O60488 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACSL4O60488 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACSL4O60488 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACSL4O60488 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACSL4O60488 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACSL4O60488 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACSL4O60488 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACSL4O60488 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACSL4O60488 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ACSL4O60488 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACSL4O60488 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACSL4O60488 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACSL4O60488 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACSL4O60488 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACSL4O60488 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACSL4O60488 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACSL4O60488 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACSL4O60488 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACSL4O60488 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACSL4O60488 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACSL4O60488 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACSL4O60488 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACSL4O60488 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACSL4O60488 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACSL4O60488 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACSL4O60488 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACSL4O60488 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACSL4O60488 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACSL4O60488 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACSL4O60488 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACSL4O60488 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACSL4O60488 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACSL4O60488 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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ACSL4O60488 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ACSL4O60488 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACSL4O60488 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ACSL4O60488 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACSL4O60488 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACSL4O60488 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACSL4O60488 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACSL4O60488 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACSL4O60488 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACSL4O60488 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACSL4O60488 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACSL4O60488 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACSL4O60488 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACSL4O60488 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACSL4O60488 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACSL4O60488 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACSL4O60488 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACSL4O60488 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACSL4O60488 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACSL4O60488 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACSL4O60488 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACSL4O60488 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACSL4O60488 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACSL4O60488 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACSL4O60488 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACSL4O60488 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ACSL4O60488 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACSL4O60488 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACSL4O60488 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACSL4O60488 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACSL4O60488 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACSL4O60488 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACSL4O60488 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACSL4O60488 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACSL4O60488 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACSL4O60488 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ACSL4O60488 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ACSL4O60488 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACSL4O60488 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACSL4O60488 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
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