Protein–RNA interactions for Protein: O43741

PRKAB2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAB2O43741 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRKAB2O43741 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKAB2O43741 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKAB2O43741 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKAB2O43741 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKAB2O43741 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKAB2O43741 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKAB2O43741 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKAB2O43741 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKAB2O43741 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKAB2O43741 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKAB2O43741 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKAB2O43741 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKAB2O43741 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKAB2O43741 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKAB2O43741 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKAB2O43741 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKAB2O43741 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKAB2O43741 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKAB2O43741 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKAB2O43741 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKAB2O43741 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKAB2O43741 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKAB2O43741 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKAB2O43741 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKAB2O43741 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKAB2O43741 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKAB2O43741 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKAB2O43741 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKAB2O43741 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKAB2O43741 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKAB2O43741 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKAB2O43741 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKAB2O43741 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKAB2O43741 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKAB2O43741 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKAB2O43741 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKAB2O43741 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKAB2O43741 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKAB2O43741 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKAB2O43741 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKAB2O43741 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKAB2O43741 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKAB2O43741 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKAB2O43741 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKAB2O43741 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKAB2O43741 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKAB2O43741 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKAB2O43741 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKAB2O43741 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKAB2O43741 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKAB2O43741 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRKAB2O43741 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRKAB2O43741 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRKAB2O43741 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRKAB2O43741 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRKAB2O43741 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRKAB2O43741 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRKAB2O43741 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRKAB2O43741 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRKAB2O43741 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PRKAB2O43741 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRKAB2O43741 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRKAB2O43741 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRKAB2O43741 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRKAB2O43741 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRKAB2O43741 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRKAB2O43741 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRKAB2O43741 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PRKAB2O43741 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PRKAB2O43741 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRKAB2O43741 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRKAB2O43741 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PRKAB2O43741 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRKAB2O43741 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PRKAB2O43741 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRKAB2O43741 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRKAB2O43741 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRKAB2O43741 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PRKAB2O43741 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PRKAB2O43741 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PRKAB2O43741 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRKAB2O43741 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRKAB2O43741 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRKAB2O43741 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRKAB2O43741 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRKAB2O43741 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRKAB2O43741 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRKAB2O43741 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRKAB2O43741 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRKAB2O43741 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRKAB2O43741 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRKAB2O43741 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRKAB2O43741 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRKAB2O43741 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRKAB2O43741 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRKAB2O43741 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PRKAB2O43741 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PRKAB2O43741 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PRKAB2O43741 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms