Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 HIST1H2BF-201ENST00000356530 1196 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 KIR2DL4-207ENST00000396293 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 TPRKB-203ENST00000409716 816 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 LINC00483-202ENST00000419688 558 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 NR4A1-209ENST00000548232 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 SERPINA1-209ENST00000449399 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 MC5R-201ENST00000324750 1319 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 FAM197Y6-201ENST00000420524 766 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 IGHEP2-201ENST00000519308 1256 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 TMEM123-208ENST00000532161 743 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 AC016266.1-201ENST00000557558 729 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 AC104590.1-201ENST00000560813 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 TRAPPC2L-212ENST00000567312 499 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 PDHB-201ENST00000302746 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 DKKL1P1-201ENST00000400550 698 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 AC006329.1-201ENST00000419422 705 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 RPS18P9-201ENST00000482817 460 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 MUSTN1-202ENST00000486659 622 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 HOXC-AS3-203ENST00000514702 368 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 LINC01485-202ENST00000520324 566 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 MT2A-202ENST00000561491 581 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 TRMT112P3-201ENST00000580149 358 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 RNF103-CHMP3-202ENST00000604011 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 GNG14-201ENST00000640117 210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 PRMT2-216ENST00000621201 1301 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPRTO14522 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.7 ms