Protein–RNA interactions for Protein: A2RTX5

TARSL2, Probable threonine--tRNA ligase 2, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARSL2A2RTX5 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TARSL2A2RTX5 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TARSL2A2RTX5 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TARSL2A2RTX5 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TARSL2A2RTX5 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TARSL2A2RTX5 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TARSL2A2RTX5 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TARSL2A2RTX5 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TARSL2A2RTX5 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TARSL2A2RTX5 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TARSL2A2RTX5 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TARSL2A2RTX5 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TARSL2A2RTX5 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TARSL2A2RTX5 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TARSL2A2RTX5 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TARSL2A2RTX5 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TARSL2A2RTX5 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TARSL2A2RTX5 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TARSL2A2RTX5 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TARSL2A2RTX5 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TARSL2A2RTX5 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TARSL2A2RTX5 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TARSL2A2RTX5 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TARSL2A2RTX5 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TARSL2A2RTX5 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TARSL2A2RTX5 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TARSL2A2RTX5 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TARSL2A2RTX5 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TARSL2A2RTX5 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TARSL2A2RTX5 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TARSL2A2RTX5 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TARSL2A2RTX5 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TARSL2A2RTX5 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TARSL2A2RTX5 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TARSL2A2RTX5 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TARSL2A2RTX5 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TARSL2A2RTX5 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TARSL2A2RTX5 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TARSL2A2RTX5 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TARSL2A2RTX5 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TARSL2A2RTX5 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TARSL2A2RTX5 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TARSL2A2RTX5 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TARSL2A2RTX5 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TARSL2A2RTX5 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TARSL2A2RTX5 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TARSL2A2RTX5 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TARSL2A2RTX5 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TARSL2A2RTX5 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TARSL2A2RTX5 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TARSL2A2RTX5 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TARSL2A2RTX5 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TARSL2A2RTX5 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TARSL2A2RTX5 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TARSL2A2RTX5 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TARSL2A2RTX5 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TARSL2A2RTX5 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TARSL2A2RTX5 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TARSL2A2RTX5 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TARSL2A2RTX5 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TARSL2A2RTX5 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TARSL2A2RTX5 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TARSL2A2RTX5 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TARSL2A2RTX5 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TARSL2A2RTX5 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TARSL2A2RTX5 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TARSL2A2RTX5 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TARSL2A2RTX5 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TARSL2A2RTX5 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TARSL2A2RTX5 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TARSL2A2RTX5 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TARSL2A2RTX5 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TARSL2A2RTX5 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TARSL2A2RTX5 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TARSL2A2RTX5 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TARSL2A2RTX5 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TARSL2A2RTX5 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TARSL2A2RTX5 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TARSL2A2RTX5 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TARSL2A2RTX5 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TARSL2A2RTX5 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TARSL2A2RTX5 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TARSL2A2RTX5 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TARSL2A2RTX5 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TARSL2A2RTX5 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TARSL2A2RTX5 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TARSL2A2RTX5 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TARSL2A2RTX5 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TARSL2A2RTX5 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TARSL2A2RTX5 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TARSL2A2RTX5 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TARSL2A2RTX5 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TARSL2A2RTX5 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TARSL2A2RTX5 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TARSL2A2RTX5 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TARSL2A2RTX5 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TARSL2A2RTX5 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TARSL2A2RTX5 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TARSL2A2RTX5 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TARSL2A2RTX5 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms