Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TTF2Q9UNY4 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms