Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
CTNNA3Q9UI47 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CTNNA3Q9UI47 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms