Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR7

TBCCD1, TBCC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBCCD1Q9NVR7 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 FAM120B-205ENST00000630384 3721 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 MKL1-201ENST00000355630 4496 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 TBC1D26-201ENST00000437605 1868 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 SLC2A14-213ENST00000539924 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 FAM201A-201ENST00000377680 3437 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 GRIPAP1-215ENST00000622599 2881 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 HRC-201ENST00000252825 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 GFAP-201ENST00000253408 3135 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 CICP1-201ENST00000416803 2410 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
TBCCD1Q9NVR7 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
TBCCD1Q9NVR7 NEXN-201ENST00000330010 3195 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
TBCCD1Q9NVR7 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
TBCCD1Q9NVR7 C3orf18-206ENST00000449241 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
TBCCD1Q9NVR7 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
TBCCD1Q9NVR7 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
TBCCD1Q9NVR7 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
TBCCD1Q9NVR7 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
TBCCD1Q9NVR7 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
TBCCD1Q9NVR7 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TBCCD1Q9NVR7 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TBCCD1Q9NVR7 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TBCCD1Q9NVR7 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TBCCD1Q9NVR7 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TBCCD1Q9NVR7 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TBCCD1Q9NVR7 SLC8A3-205ENST00000394330 2622 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TBCCD1Q9NVR7 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TBCCD1Q9NVR7 MMP14-201ENST00000311852 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TBCCD1Q9NVR7 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TBCCD1Q9NVR7 CPT1C-204ENST00000405931 2785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TBCCD1Q9NVR7 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TBCCD1Q9NVR7 IFT81-201ENST00000242591 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TBCCD1Q9NVR7 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TBCCD1Q9NVR7 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TBCCD1Q9NVR7 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms