Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LMBRD1Q9NUN5 ZSCAN16-AS1-201ENST00000600652 2163 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LMBRD1Q9NUN5 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LMBRD1Q9NUN5 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LMBRD1Q9NUN5 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LMBRD1Q9NUN5 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LMBRD1Q9NUN5 GEM-201ENST00000297596 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LMBRD1Q9NUN5 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LMBRD1Q9NUN5 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LMBRD1Q9NUN5 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LMBRD1Q9NUN5 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LMBRD1Q9NUN5 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LMBRD1Q9NUN5 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LMBRD1Q9NUN5 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LMBRD1Q9NUN5 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LMBRD1Q9NUN5 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LMBRD1Q9NUN5 ALOX15B-202ENST00000380183 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LMBRD1Q9NUN5 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LMBRD1Q9NUN5 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LMBRD1Q9NUN5 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LMBRD1Q9NUN5 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LMBRD1Q9NUN5 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LMBRD1Q9NUN5 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LMBRD1Q9NUN5 RAB40A-202ENST00000372633 3126 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LMBRD1Q9NUN5 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LMBRD1Q9NUN5 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LMBRD1Q9NUN5 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
LMBRD1Q9NUN5 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LMBRD1Q9NUN5 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LMBRD1Q9NUN5 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LMBRD1Q9NUN5 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LMBRD1Q9NUN5 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LMBRD1Q9NUN5 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LMBRD1Q9NUN5 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
LMBRD1Q9NUN5 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LMBRD1Q9NUN5 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LMBRD1Q9NUN5 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LMBRD1Q9NUN5 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LMBRD1Q9NUN5 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LMBRD1Q9NUN5 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LMBRD1Q9NUN5 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LMBRD1Q9NUN5 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LMBRD1Q9NUN5 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LMBRD1Q9NUN5 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LMBRD1Q9NUN5 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LMBRD1Q9NUN5 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LMBRD1Q9NUN5 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LMBRD1Q9NUN5 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LMBRD1Q9NUN5 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LMBRD1Q9NUN5 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
LMBRD1Q9NUN5 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LMBRD1Q9NUN5 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LMBRD1Q9NUN5 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LMBRD1Q9NUN5 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LMBRD1Q9NUN5 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LMBRD1Q9NUN5 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LMBRD1Q9NUN5 KIAA1614-201ENST00000367587 3309 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LMBRD1Q9NUN5 MRPL17-201ENST00000288937 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LMBRD1Q9NUN5 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LMBRD1Q9NUN5 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LMBRD1Q9NUN5 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LMBRD1Q9NUN5 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LMBRD1Q9NUN5 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LMBRD1Q9NUN5 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LMBRD1Q9NUN5 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LMBRD1Q9NUN5 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LMBRD1Q9NUN5 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
LMBRD1Q9NUN5 AAR2-202ENST00000373932 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LMBRD1Q9NUN5 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LMBRD1Q9NUN5 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LMBRD1Q9NUN5 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LMBRD1Q9NUN5 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
LMBRD1Q9NUN5 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LMBRD1Q9NUN5 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LMBRD1Q9NUN5 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LMBRD1Q9NUN5 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
LMBRD1Q9NUN5 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LMBRD1Q9NUN5 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LMBRD1Q9NUN5 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LMBRD1Q9NUN5 LIMK1-208ENST00000538333 2170 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LMBRD1Q9NUN5 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LMBRD1Q9NUN5 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LMBRD1Q9NUN5 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LMBRD1Q9NUN5 ZNF721-205ENST00000511833 2966 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LMBRD1Q9NUN5 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LMBRD1Q9NUN5 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LMBRD1Q9NUN5 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LMBRD1Q9NUN5 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
LMBRD1Q9NUN5 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LMBRD1Q9NUN5 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LMBRD1Q9NUN5 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LMBRD1Q9NUN5 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LMBRD1Q9NUN5 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LMBRD1Q9NUN5 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LMBRD1Q9NUN5 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LMBRD1Q9NUN5 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LMBRD1Q9NUN5 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LMBRD1Q9NUN5 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LMBRD1Q9NUN5 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LMBRD1Q9NUN5 RXRG-204ENST00000619224 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms