Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW72

HIGD2A, HIG1 domain family member 2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD2AQ9BW72 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC9.49□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.49□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 ABCA3-201ENST00000301732 6609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 AKNA-202ENST00000307564 7380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 IGFN1-201ENST00000295591 4439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 HPSE-201ENST00000311412 4615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 PRRT2-201ENST00000300797 3002 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 SOGA3-207ENST00000481848 11464 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 CEP131-201ENST00000269392 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 ROBO2-209ENST00000487694 5919 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 URGCP-201ENST00000336086 5658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 SLC44A3-AS1-215ENST00000634870 5956 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC9.48□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC9.48□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC9.48□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 ZNF843-202ENST00000564218 3816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC9.48□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC9.48□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 KDM2A-210ENST00000529006 6967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 PTPRK-204ENST00000368210 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 HCFC1-202ENST00000369984 8375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 CACNA1F-201ENST00000323022 6037 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 SYNM-203ENST00000560674 5908 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 FMNL3-205ENST00000550488 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 SPECC1-206ENST00000395530 8133 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 GAB2-201ENST00000340149 6052 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms