Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVS4

RIOK2, Serine/threonine-protein kinase RIO2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK2Q9BVS4 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RIOK2Q9BVS4 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RIOK2Q9BVS4 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RIOK2Q9BVS4 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RIOK2Q9BVS4 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RIOK2Q9BVS4 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RIOK2Q9BVS4 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RIOK2Q9BVS4 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RIOK2Q9BVS4 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RIOK2Q9BVS4 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RIOK2Q9BVS4 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RIOK2Q9BVS4 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RIOK2Q9BVS4 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RIOK2Q9BVS4 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RIOK2Q9BVS4 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RIOK2Q9BVS4 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RIOK2Q9BVS4 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RIOK2Q9BVS4 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RIOK2Q9BVS4 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RIOK2Q9BVS4 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RIOK2Q9BVS4 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RIOK2Q9BVS4 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RIOK2Q9BVS4 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RIOK2Q9BVS4 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RIOK2Q9BVS4 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RIOK2Q9BVS4 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RIOK2Q9BVS4 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RIOK2Q9BVS4 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RIOK2Q9BVS4 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RIOK2Q9BVS4 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RIOK2Q9BVS4 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RIOK2Q9BVS4 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RIOK2Q9BVS4 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RIOK2Q9BVS4 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RIOK2Q9BVS4 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RIOK2Q9BVS4 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RIOK2Q9BVS4 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RIOK2Q9BVS4 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RIOK2Q9BVS4 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RIOK2Q9BVS4 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RIOK2Q9BVS4 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RIOK2Q9BVS4 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RIOK2Q9BVS4 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RIOK2Q9BVS4 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RIOK2Q9BVS4 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RIOK2Q9BVS4 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RIOK2Q9BVS4 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RIOK2Q9BVS4 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RIOK2Q9BVS4 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RIOK2Q9BVS4 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RIOK2Q9BVS4 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RIOK2Q9BVS4 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RIOK2Q9BVS4 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RIOK2Q9BVS4 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RIOK2Q9BVS4 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RIOK2Q9BVS4 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RIOK2Q9BVS4 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RIOK2Q9BVS4 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RIOK2Q9BVS4 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RIOK2Q9BVS4 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RIOK2Q9BVS4 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RIOK2Q9BVS4 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RIOK2Q9BVS4 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RIOK2Q9BVS4 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RIOK2Q9BVS4 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RIOK2Q9BVS4 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RIOK2Q9BVS4 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RIOK2Q9BVS4 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RIOK2Q9BVS4 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RIOK2Q9BVS4 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RIOK2Q9BVS4 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RIOK2Q9BVS4 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RIOK2Q9BVS4 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RIOK2Q9BVS4 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RIOK2Q9BVS4 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RIOK2Q9BVS4 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RIOK2Q9BVS4 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RIOK2Q9BVS4 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RIOK2Q9BVS4 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RIOK2Q9BVS4 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RIOK2Q9BVS4 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RIOK2Q9BVS4 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RIOK2Q9BVS4 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RIOK2Q9BVS4 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RIOK2Q9BVS4 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RIOK2Q9BVS4 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RIOK2Q9BVS4 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RIOK2Q9BVS4 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RIOK2Q9BVS4 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RIOK2Q9BVS4 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
RIOK2Q9BVS4 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
RIOK2Q9BVS4 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RIOK2Q9BVS4 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RIOK2Q9BVS4 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RIOK2Q9BVS4 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RIOK2Q9BVS4 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RIOK2Q9BVS4 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RIOK2Q9BVS4 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RIOK2Q9BVS4 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RIOK2Q9BVS4 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms