Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUK0

CHCHD7, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD7Q9BUK0 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC10.43□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC10.42□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC10.42□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CHCHD7Q9BUK0 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms