Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL6

SRSF8, Serine/arginine-rich splicing factor 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF8Q9BRL6 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SRSF8Q9BRL6 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.3 ms