Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPS6KC1Q96S38 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms