Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF7

GCNA, Acidic repeat-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNAQ96QF7 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GCNAQ96QF7 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms