Protein–RNA interactions for Protein: Q96P48

ARAP1, Arf-GAP with Rho-GAP domain, ANK repeat and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARAP1Q96P48 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARAP1Q96P48 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARAP1Q96P48 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARAP1Q96P48 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ARAP1Q96P48 SNX3-204ENST00000426155 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARAP1Q96P48 AC106869.1-201ENST00000448713 577 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARAP1Q96P48 VENTXP4-201ENST00000449029 958 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ARAP1Q96P48 RPS23-207ENST00000511844 530 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARAP1Q96P48 EXTL3-AS1-203ENST00000520023 780 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARAP1Q96P48 URB1-AS1-201ENST00000534991 831 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ARAP1Q96P48 FOXN3-AS2-201ENST00000554071 1262 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ARAP1Q96P48 AC016266.1-201ENST00000557558 729 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARAP1Q96P48 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ARAP1Q96P48 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARAP1Q96P48 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARAP1Q96P48 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARAP1Q96P48 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARAP1Q96P48 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARAP1Q96P48 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARAP1Q96P48 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARAP1Q96P48 FCRL6-202ENST00000339348 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARAP1Q96P48 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARAP1Q96P48 MRPL55-205ENST00000366731 1423 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARAP1Q96P48 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARAP1Q96P48 NNMT-203ENST00000535401 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARAP1Q96P48 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARAP1Q96P48 MRPL33-201ENST00000296102 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARAP1Q96P48 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARAP1Q96P48 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ARAP1Q96P48 MRPL33-202ENST00000379666 404 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARAP1Q96P48 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARAP1Q96P48 AC093609.1-201ENST00000434020 952 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARAP1Q96P48 CDCA4P4-201ENST00000435216 680 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ARAP1Q96P48 RPL15-208ENST00000435882 1063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARAP1Q96P48 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARAP1Q96P48 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ARAP1Q96P48 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARAP1Q96P48 PGAP2-207ENST00000463452 931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARAP1Q96P48 TMEM14B-208ENST00000467317 1224 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARAP1Q96P48 TGFBI-207ENST00000508076 1034 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARAP1Q96P48 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ARAP1Q96P48 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARAP1Q96P48 LINC01002-234ENST00000633808 848 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARAP1Q96P48 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARAP1Q96P48 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARAP1Q96P48 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARAP1Q96P48 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARAP1Q96P48 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ARAP1Q96P48 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARAP1Q96P48 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ARAP1Q96P48 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARAP1Q96P48 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARAP1Q96P48 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARAP1Q96P48 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARAP1Q96P48 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARAP1Q96P48 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARAP1Q96P48 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARAP1Q96P48 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARAP1Q96P48 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARAP1Q96P48 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARAP1Q96P48 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARAP1Q96P48 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARAP1Q96P48 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARAP1Q96P48 MAD2L1BP-202ENST00000451025 1517 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARAP1Q96P48 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARAP1Q96P48 MYL4-202ENST00000393450 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARAP1Q96P48 AC006329.1-201ENST00000419422 705 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARAP1Q96P48 CITED1-209ENST00000453707 998 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARAP1Q96P48 C10orf91-203ENST00000490765 462 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARAP1Q96P48 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARAP1Q96P48 ADAMTS9-AS1-216ENST00000626280 882 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARAP1Q96P48 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARAP1Q96P48 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARAP1Q96P48 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARAP1Q96P48 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARAP1Q96P48 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARAP1Q96P48 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARAP1Q96P48 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARAP1Q96P48 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARAP1Q96P48 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ARAP1Q96P48 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARAP1Q96P48 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARAP1Q96P48 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARAP1Q96P48 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARAP1Q96P48 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ARAP1Q96P48 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ARAP1Q96P48 IZUMO1R-201ENST00000328458 798 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARAP1Q96P48 RPS9-202ENST00000391751 510 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARAP1Q96P48 AL357833.1-201ENST00000413993 832 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARAP1Q96P48 BX248123.1-201ENST00000429070 606 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARAP1Q96P48 AL512599.1-201ENST00000430724 685 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ARAP1Q96P48 AL356000.1-201ENST00000441073 1238 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ARAP1Q96P48 FOXP4-AS1-205ENST00000454812 575 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARAP1Q96P48 NUDCD2-202ENST00000517501 448 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARAP1Q96P48 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARAP1Q96P48 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARAP1Q96P48 CBR3-AS1-206ENST00000608632 659 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARAP1Q96P48 SRP19-208ENST00000621420 1270 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARAP1Q96P48 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARAP1Q96P48 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms