Protein–RNA interactions for Protein: Q96GS4

BORCS6, BLOC-1-related complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS6Q96GS4 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 TAB2-208ENST00000636456 3092 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 TMUB2-201ENST00000319511 2418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BORCS6Q96GS4 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms