Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX1

SMIM12, Small integral membrane protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM12Q96EX1 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 C1orf109-201ENST00000358011 2355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 SIN3A-202ENST00000394947 6737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 PDE9A-201ENST00000291539 2058 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 DRD2-201ENST00000346454 2433 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 UNC13B-206ENST00000617908 6432 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 TNN-202ENST00000621086 4234 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 MRVI1-201ENST00000423302 6126 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 PSME4-202ENST00000404125 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 SEC14L3-204ENST00000403066 2474 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 RNF43-202ENST00000577625 2198 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 COL2A1-201ENST00000337299 4257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 PCDHGB7-202ENST00000612073 2785 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 FAM118A-201ENST00000216214 3458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 CENPP-203ENST00000375587 8766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 LINC02188-202ENST00000569740 3775 ntTSL 4 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 SFMBT2-201ENST00000361972 7922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 BCL2L1-202ENST00000376055 2383 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 NR4A2-209ENST00000426264 2642 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 SRRM4-201ENST00000267260 8477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 SH3PXD2B-201ENST00000311601 7777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 KIAA1614-202ENST00000367588 9654 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 CARHSP1-202ENST00000396593 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 AL358334.2-201ENST00000553648 4714 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 AR-208ENST00000612452 10676 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 CNP-202ENST00000393892 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SMIM12Q96EX1 TMEM229B-207ENST00000557006 3941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms