Protein–RNA interactions for Protein: Q969F9

HPS3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS3Q969F9 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HPS3Q969F9 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HPS3Q969F9 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HPS3Q969F9 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HPS3Q969F9 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HPS3Q969F9 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HPS3Q969F9 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HPS3Q969F9 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HPS3Q969F9 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HPS3Q969F9 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HPS3Q969F9 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HPS3Q969F9 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HPS3Q969F9 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HPS3Q969F9 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HPS3Q969F9 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HPS3Q969F9 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HPS3Q969F9 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HPS3Q969F9 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HPS3Q969F9 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HPS3Q969F9 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HPS3Q969F9 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HPS3Q969F9 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HPS3Q969F9 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HPS3Q969F9 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HPS3Q969F9 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HPS3Q969F9 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HPS3Q969F9 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HPS3Q969F9 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HPS3Q969F9 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HPS3Q969F9 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HPS3Q969F9 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HPS3Q969F9 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HPS3Q969F9 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HPS3Q969F9 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HPS3Q969F9 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HPS3Q969F9 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HPS3Q969F9 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HPS3Q969F9 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HPS3Q969F9 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HPS3Q969F9 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HPS3Q969F9 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HPS3Q969F9 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HPS3Q969F9 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HPS3Q969F9 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HPS3Q969F9 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HPS3Q969F9 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HPS3Q969F9 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HPS3Q969F9 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HPS3Q969F9 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HPS3Q969F9 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HPS3Q969F9 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HPS3Q969F9 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HPS3Q969F9 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HPS3Q969F9 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HPS3Q969F9 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HPS3Q969F9 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HPS3Q969F9 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HPS3Q969F9 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HPS3Q969F9 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HPS3Q969F9 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HPS3Q969F9 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HPS3Q969F9 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HPS3Q969F9 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HPS3Q969F9 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HPS3Q969F9 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HPS3Q969F9 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HPS3Q969F9 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HPS3Q969F9 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HPS3Q969F9 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HPS3Q969F9 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HPS3Q969F9 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HPS3Q969F9 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HPS3Q969F9 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HPS3Q969F9 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HPS3Q969F9 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HPS3Q969F9 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HPS3Q969F9 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HPS3Q969F9 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HPS3Q969F9 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HPS3Q969F9 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HPS3Q969F9 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HPS3Q969F9 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HPS3Q969F9 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HPS3Q969F9 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HPS3Q969F9 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HPS3Q969F9 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HPS3Q969F9 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HPS3Q969F9 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HPS3Q969F9 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HPS3Q969F9 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HPS3Q969F9 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HPS3Q969F9 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HPS3Q969F9 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HPS3Q969F9 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HPS3Q969F9 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HPS3Q969F9 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HPS3Q969F9 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HPS3Q969F9 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HPS3Q969F9 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HPS3Q969F9 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms