Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC12Q8WUD4 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms