Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6D2

RNF182, E3 ubiquitin-protein ligase RNF182, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF182Q8N6D2 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 FLNC-202ENST00000346177 9042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 PRDM16-201ENST00000270722 8690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 ACOX1-201ENST00000293217 7514 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 GRWD1-201ENST00000253237 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 ZDHHC15-201ENST00000373367 5796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 GAB1-202ENST00000262995 7981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC11.32□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 DGKD-201ENST00000264057 6297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 CX3CL1-204ENST00000565912 5796 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 HECTD1-203ENST00000553700 9080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.31□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms