Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTM1

OTOP1, Otopetrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP1Q7RTM1 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
OTOP1Q7RTM1 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
OTOP1Q7RTM1 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
OTOP1Q7RTM1 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
OTOP1Q7RTM1 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
OTOP1Q7RTM1 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
OTOP1Q7RTM1 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
OTOP1Q7RTM1 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
OTOP1Q7RTM1 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
OTOP1Q7RTM1 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
OTOP1Q7RTM1 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
OTOP1Q7RTM1 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
OTOP1Q7RTM1 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
OTOP1Q7RTM1 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
OTOP1Q7RTM1 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
OTOP1Q7RTM1 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
OTOP1Q7RTM1 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
OTOP1Q7RTM1 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
OTOP1Q7RTM1 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
OTOP1Q7RTM1 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
OTOP1Q7RTM1 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
OTOP1Q7RTM1 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
OTOP1Q7RTM1 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
OTOP1Q7RTM1 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
OTOP1Q7RTM1 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
OTOP1Q7RTM1 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
OTOP1Q7RTM1 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
OTOP1Q7RTM1 GCSHP3-201ENST00000431120 391 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
OTOP1Q7RTM1 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
OTOP1Q7RTM1 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
OTOP1Q7RTM1 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
OTOP1Q7RTM1 SIX3-AS1-202ENST00000456467 557 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
OTOP1Q7RTM1 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
OTOP1Q7RTM1 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
OTOP1Q7RTM1 AC100778.2-201ENST00000580150 483 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
OTOP1Q7RTM1 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
OTOP1Q7RTM1 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
OTOP1Q7RTM1 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
OTOP1Q7RTM1 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
OTOP1Q7RTM1 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
OTOP1Q7RTM1 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
OTOP1Q7RTM1 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
OTOP1Q7RTM1 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
OTOP1Q7RTM1 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
OTOP1Q7RTM1 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
OTOP1Q7RTM1 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
OTOP1Q7RTM1 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
OTOP1Q7RTM1 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
OTOP1Q7RTM1 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
OTOP1Q7RTM1 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
OTOP1Q7RTM1 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
OTOP1Q7RTM1 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
OTOP1Q7RTM1 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
OTOP1Q7RTM1 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
OTOP1Q7RTM1 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
OTOP1Q7RTM1 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
OTOP1Q7RTM1 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
OTOP1Q7RTM1 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
OTOP1Q7RTM1 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
OTOP1Q7RTM1 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
OTOP1Q7RTM1 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
OTOP1Q7RTM1 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
OTOP1Q7RTM1 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
OTOP1Q7RTM1 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
OTOP1Q7RTM1 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
OTOP1Q7RTM1 KRT17P4-201ENST00000429445 819 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
OTOP1Q7RTM1 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
OTOP1Q7RTM1 AC069208.1-205ENST00000456299 576 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
OTOP1Q7RTM1 HIST2H2BF-204ENST00000545683 999 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
OTOP1Q7RTM1 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
OTOP1Q7RTM1 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
OTOP1Q7RTM1 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
OTOP1Q7RTM1 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
OTOP1Q7RTM1 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
OTOP1Q7RTM1 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
OTOP1Q7RTM1 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
OTOP1Q7RTM1 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
OTOP1Q7RTM1 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
OTOP1Q7RTM1 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
OTOP1Q7RTM1 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
OTOP1Q7RTM1 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
OTOP1Q7RTM1 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
OTOP1Q7RTM1 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
OTOP1Q7RTM1 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
OTOP1Q7RTM1 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
OTOP1Q7RTM1 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
OTOP1Q7RTM1 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
OTOP1Q7RTM1 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
OTOP1Q7RTM1 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
OTOP1Q7RTM1 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
OTOP1Q7RTM1 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
OTOP1Q7RTM1 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
OTOP1Q7RTM1 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
OTOP1Q7RTM1 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
OTOP1Q7RTM1 NDUFB11-202ENST00000377811 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
OTOP1Q7RTM1 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
OTOP1Q7RTM1 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
OTOP1Q7RTM1 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
OTOP1Q7RTM1 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
OTOP1Q7RTM1 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms