Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 STRA6-222ENST00000616000 2843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 LINC02069-201ENST00000457449 2591 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 ATP11AUN-201ENST00000623100 2241 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 AL049829.3-201ENST00000604456 1875 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 CDHR5-202ENST00000358353 3635 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC11.54□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC11.54□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 KCNIP2-203ENST00000348850 2089 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 ASNS-203ENST00000394309 2289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 RABGEF1-210ENST00000437078 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 SIGLEC8-201ENST00000321424 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
C16orf54Q6UWD8 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms