Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB30

CSAG1, Putative chondrosarcoma-associated gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1Q6PB30 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 DCAF11-204ENST00000446197 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 PI4KB-204ENST00000368875 3983 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 ATXN2L-203ENST00000340394 3807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 PHF13-201ENST00000377648 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 ALDH18A1-202ENST00000371224 3359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 RBM33-203ENST00000341148 7058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 MPZL2-201ENST00000278937 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 GNAS-214ENST00000371100 4029 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 GRIN1-205ENST00000371555 4003 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 PRKD1-201ENST00000331968 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 SMPDL3B-202ENST00000373894 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 PRR29-202ENST00000412177 3127 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 MTMR4-204ENST00000579925 5622 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 LRCH3-203ENST00000425562 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.73□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC7.73□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC7.73□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC7.73□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 MADD-204ENST00000395336 5942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 TMEM134-201ENST00000308022 3534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 RAB37-205ENST00000392614 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 DYSF-203ENST00000409366 6606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 DYSF-205ENST00000409651 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 GNAI2-203ENST00000422163 2407 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 DPP3-211ENST00000532677 3078 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 TNFAIP3-206ENST00000612899 4735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 GALNT6-202ENST00000543196 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 ANKRD36B-204ENST00000438709 6067 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 AL031714.1-202ENST00000568106 3107 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 INTS13-201ENST00000261191 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 ITGA3-201ENST00000007722 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 OCA2-202ENST00000354638 3186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 DFFA-202ENST00000377038 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 TRMT1L-201ENST00000367506 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 AC021218.1-201ENST00000377722 2536 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 TNRC6C-211ENST00000636222 7093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 XIRP1-201ENST00000340369 6460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms