Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT06

CEP350, Centrosome-associated protein 350, humanhuman

Predictions only

Length 3,117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP350Q5VT06 SEC11A-203ENST00000558134 971 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CEP350Q5VT06 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CEP350Q5VT06 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CEP350Q5VT06 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CEP350Q5VT06 RBMS3-210ENST00000456853 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CEP350Q5VT06 CACNA1A-211ENST00000592864 1623 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CEP350Q5VT06 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CEP350Q5VT06 AL137078.1-201ENST00000446280 404 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CEP350Q5VT06 LDHAL6CP-201ENST00000502352 1142 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CEP350Q5VT06 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CEP350Q5VT06 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CEP350Q5VT06 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CEP350Q5VT06 MMP19-202ENST00000409200 1431 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CEP350Q5VT06 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CEP350Q5VT06 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CEP350Q5VT06 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CEP350Q5VT06 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CEP350Q5VT06 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CEP350Q5VT06 AL359853.1-202ENST00000415218 544 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CEP350Q5VT06 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CEP350Q5VT06 AC005011.1-201ENST00000455206 210 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CEP350Q5VT06 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CEP350Q5VT06 ELOBP2-201ENST00000526184 355 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CEP350Q5VT06 AP001979.2-201ENST00000526254 975 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CEP350Q5VT06 HIST2H4A-201ENST00000578186 583 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CEP350Q5VT06 PFDN5-220ENST00000628881 231 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CEP350Q5VT06 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CEP350Q5VT06 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CEP350Q5VT06 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CEP350Q5VT06 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CEP350Q5VT06 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CEP350Q5VT06 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CEP350Q5VT06 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CEP350Q5VT06 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CEP350Q5VT06 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CEP350Q5VT06 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CEP350Q5VT06 FAM21EP-201ENST00000417804 985 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CEP350Q5VT06 PSME2P2-201ENST00000453033 700 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CEP350Q5VT06 AC092903.1-201ENST00000466506 262 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CEP350Q5VT06 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CEP350Q5VT06 NKAPP1-203ENST00000554109 573 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CEP350Q5VT06 NPTN-205ENST00000563691 1214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CEP350Q5VT06 Metazoa_SRP.64-201ENST00000611904 268 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CEP350Q5VT06 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CEP350Q5VT06 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CEP350Q5VT06 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CEP350Q5VT06 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CEP350Q5VT06 CLUL1-202ENST00000400606 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CEP350Q5VT06 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CEP350Q5VT06 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CEP350Q5VT06 HDGF-202ENST00000368206 960 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CEP350Q5VT06 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CEP350Q5VT06 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CEP350Q5VT06 KRT18P62-201ENST00000446618 1287 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CEP350Q5VT06 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CEP350Q5VT06 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CEP350Q5VT06 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CEP350Q5VT06 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CEP350Q5VT06 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CEP350Q5VT06 PSMC3IP-201ENST00000253789 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CEP350Q5VT06 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CEP350Q5VT06 FUNDC1-201ENST00000378045 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CEP350Q5VT06 ACP1-207ENST00000439645 605 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CEP350Q5VT06 IGKV2-28-201ENST00000482769 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CEP350Q5VT06 VEGFA-219ENST00000518824 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CEP350Q5VT06 AC005323.2-202ENST00000581304 493 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CEP350Q5VT06 IRF3-213ENST00000596765 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CEP350Q5VT06 APOBEC3A-205ENST00000618553 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CEP350Q5VT06 AC126755.5-201ENST00000622756 267 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CEP350Q5VT06 OR2T11-201ENST00000625105 1072 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CEP350Q5VT06 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CEP350Q5VT06 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CEP350Q5VT06 FAM83A-AS1-202ENST00000520576 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CEP350Q5VT06 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CEP350Q5VT06 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CEP350Q5VT06 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CEP350Q5VT06 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CEP350Q5VT06 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CEP350Q5VT06 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CEP350Q5VT06 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CEP350Q5VT06 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CEP350Q5VT06 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
CEP350Q5VT06 SHISA5-206ENST00000426002 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CEP350Q5VT06 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CEP350Q5VT06 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CEP350Q5VT06 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CEP350Q5VT06 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CEP350Q5VT06 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CEP350Q5VT06 REG3A-201ENST00000305165 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CEP350Q5VT06 AC103563.1-201ENST00000429316 123 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CEP350Q5VT06 SATB2-AS1-202ENST00000441234 468 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CEP350Q5VT06 PRDX2P3-201ENST00000515779 586 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CEP350Q5VT06 AC005332.2-201ENST00000590010 930 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CEP350Q5VT06 AC012313.2-201ENST00000599952 1154 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CEP350Q5VT06 PTMAP5-202ENST00000607242 1162 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CEP350Q5VT06 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CEP350Q5VT06 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CEP350Q5VT06 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CEP350Q5VT06 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CEP350Q5VT06 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms