Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 GLP1R-201ENST00000373256 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 LGALS3BP-201ENST00000262776 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 AC092802.1-201ENST00000421762 2447 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 GALNT15-203ENST00000437509 2416 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM74B-201ENST00000381894 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 TRGV9-201ENST00000444775 1735 ntAPPRIS P1 BASIC2.28□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC2.28□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 CHTF18-201ENST00000262315 3090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 MALL-201ENST00000272462 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 LINC01634-201ENST00000443243 2379 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 ELOVL4-201ENST00000369816 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 STAT6-202ENST00000454075 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 XRCC3-202ENST00000553264 3018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 OPN4-201ENST00000241891 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 MTMR11-201ENST00000369140 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 LINC01141-203ENST00000426428 2993 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 SIGLEC8-201ENST00000321424 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 MICA-210ENST00000616296 2260 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 FBXL18-201ENST00000382368 3498 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 TESMIN-204ENST00000443940 3495 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 IL1R2-201ENST00000332549 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 ARRB2-218ENST00000575877 1579 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 EGLN3-205ENST00000547327 2849 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 NOA1-201ENST00000264230 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF185-205ENST00000370270 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 PES1-203ENST00000402281 2760 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 C14orf159-219ENST00000521077 2719 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 YTHDF2-208ENST00000541996 2719 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 ITGA2B-201ENST00000262407 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 NPAS4-201ENST00000311034 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 NXPE3-201ENST00000273347 3941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF384-201ENST00000319770 3266 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 SP140L-203ENST00000415673 2665 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 LINC02202-201ENST00000499583 2664 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 ACVR1-203ENST00000410057 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 ZFYVE19-209ENST00000564258 2059 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 SLC28A1-201ENST00000286749 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 LINC00365-201ENST00000413591 2618 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 AL139220.2-207ENST00000434244 2644 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF302-203ENST00000457781 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 WDR60-202ENST00000407559 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms