Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

Predictions only

Length 750 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC142Q17RM4 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms