Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

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Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PCOLCEQ15113 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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