Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CUL4BQ13620 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CUL4BQ13620 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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