Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 PSD-202ENST00000406432 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 USP19-202ENST00000398888 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 NSD2-203ENST00000382888 2666 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 WIZ-202ENST00000389282 4067 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 C12orf43-202ENST00000445832 2397 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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CUL3Q13618 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CUL3Q13618 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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