Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 SECISBP2-201ENST00000339901 3320 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 GAS8-220ENST00000620723 3308 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 OFD1-203ENST00000380567 3736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 KCNMA1-216ENST00000457953 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 GALC-201ENST00000261304 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 HERC6-202ENST00000273960 3473 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 MED24-204ENST00000394128 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 NDRG4-201ENST00000258187 3324 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 ARMCX2-202ENST00000330154 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 SLC44A4-202ENST00000229729 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 LINC01623-201ENST00000440244 2458 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 PTPN6-202ENST00000399448 2159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 TRGV9-201ENST00000444775 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 KCNJ11-201ENST00000339994 2801 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 LINC01024-201ENST00000499203 2769 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 SLC45A2-202ENST00000382102 2723 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 SLC28A1-201ENST00000286749 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 ELMOD3-206ENST00000409890 2492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 NUTM2A-AS1-208ENST00000446751 2394 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 AC027020.2-201ENST00000602585 2389 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 RIPK4-201ENST00000332512 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 UGGT2-201ENST00000376712 2240 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 IL1RAP-211ENST00000439062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 ATF4-203ENST00000404241 1910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 PBXIP1-203ENST00000368465 3144 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 PGAP2-203ENST00000396986 1837 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 GNPDA1-210ENST00000508177 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 MUC20-203ENST00000436408 2463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 AL033529.1-201ENST00000480336 3447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 LITAF-203ENST00000413364 2292 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 CREBZF-204ENST00000527447 4037 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 AL391647.1-201ENST00000395664 511 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 CPLX4-202ENST00000587244 1916 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 PNPLA8-208ENST00000453144 3366 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 PIGG-205ENST00000503111 2629 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 GRIA4-210ENST00000527669 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 MZF1-AS1-202ENST00000600534 2567 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 AMOTL2-202ENST00000422605 4335 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LSAMPQ13449 PPP1R8-202ENST00000311772 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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