Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 AC069208.1-205ENST00000456299 576 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 EIF5AP2-201ENST00000585668 1047 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 AC244250.3-201ENST00000620749 366 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 AC073592.2-201ENST00000623062 780 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 AREG-202ENST00000502307 956 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 AC091564.6-201ENST00000526633 487 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 CLNS1A-211ENST00000532069 898 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 PRB3-202ENST00000538488 1283 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 HIST2H2BF-204ENST00000545683 999 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 AL118516.1-201ENST00000564152 670 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 AC136944.4-201ENST00000568893 660 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SRSF5Q13243 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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