Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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