Protein–RNA interactions for Protein: Q12809

KCNH2, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH2Q12809 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNH2Q12809 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNH2Q12809 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNH2Q12809 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNH2Q12809 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNH2Q12809 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNH2Q12809 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNH2Q12809 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNH2Q12809 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNH2Q12809 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNH2Q12809 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNH2Q12809 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNH2Q12809 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNH2Q12809 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNH2Q12809 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNH2Q12809 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNH2Q12809 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNH2Q12809 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNH2Q12809 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNH2Q12809 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNH2Q12809 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNH2Q12809 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNH2Q12809 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNH2Q12809 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNH2Q12809 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNH2Q12809 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNH2Q12809 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNH2Q12809 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNH2Q12809 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNH2Q12809 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNH2Q12809 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNH2Q12809 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNH2Q12809 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNH2Q12809 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNH2Q12809 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNH2Q12809 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KCNH2Q12809 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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KCNH2Q12809 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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KCNH2Q12809 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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KCNH2Q12809 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNH2Q12809 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNH2Q12809 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNH2Q12809 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNH2Q12809 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNH2Q12809 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNH2Q12809 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNH2Q12809 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNH2Q12809 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNH2Q12809 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNH2Q12809 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNH2Q12809 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNH2Q12809 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNH2Q12809 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNH2Q12809 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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KCNH2Q12809 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNH2Q12809 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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KCNH2Q12809 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNH2Q12809 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNH2Q12809 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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KCNH2Q12809 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNH2Q12809 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNH2Q12809 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNH2Q12809 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNH2Q12809 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNH2Q12809 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNH2Q12809 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNH2Q12809 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNH2Q12809 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNH2Q12809 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNH2Q12809 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNH2Q12809 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNH2Q12809 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNH2Q12809 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNH2Q12809 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNH2Q12809 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNH2Q12809 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNH2Q12809 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNH2Q12809 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNH2Q12809 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNH2Q12809 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KCNH2Q12809 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNH2Q12809 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNH2Q12809 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNH2Q12809 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNH2Q12809 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KCNH2Q12809 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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