Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 FAM201A-201ENST00000377680 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 TRIM4-203ENST00000355947 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 MKRN5P-201ENST00000445263 1467 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 VENTXP1-201ENST00000569334 2716 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 TRIM26-267ENST00000453195 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 NUTM2E-202ENST00000602967 3623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 MAMDC4-202ENST00000445819 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 SYNPR-209ENST00000478300 2709 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 MRPL17-201ENST00000288937 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 PAX8-204ENST00000397647 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 IFT81-201ENST00000242591 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 AC127496.1-201ENST00000576234 3133 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 RNF43-205ENST00000581868 2610 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 PIK3R6-204ENST00000619866 3041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 TMEM100-201ENST00000424486 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 2998 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 DDX43-201ENST00000370336 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 DLX4-206ENST00000611342 1662 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 ZC3H18-201ENST00000301011 3729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 PLOD2-202ENST00000360060 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 HOXA7-201ENST00000242159 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 ZNF341-202ENST00000375200 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 ZNF202-207ENST00000530393 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 FIBCD1-204ENST00000448616 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 ADD2-202ENST00000355733 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 DLX3-201ENST00000434704 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC173Q0VFZ6 CYP4F11-204ENST00000591841 2531 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms