Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms