Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CTDSPL2Q05D32 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTDSPL2Q05D32 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms