Protein–RNA interactions for Protein: Q03989

ARID5A, AT-rich interactive domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID5AQ03989 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARID5AQ03989 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARID5AQ03989 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARID5AQ03989 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARID5AQ03989 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARID5AQ03989 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARID5AQ03989 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ARID5AQ03989 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ARID5AQ03989 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARID5AQ03989 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARID5AQ03989 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARID5AQ03989 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARID5AQ03989 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ARID5AQ03989 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARID5AQ03989 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARID5AQ03989 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARID5AQ03989 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARID5AQ03989 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARID5AQ03989 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARID5AQ03989 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARID5AQ03989 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARID5AQ03989 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARID5AQ03989 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARID5AQ03989 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARID5AQ03989 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARID5AQ03989 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARID5AQ03989 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARID5AQ03989 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARID5AQ03989 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARID5AQ03989 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARID5AQ03989 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ARID5AQ03989 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARID5AQ03989 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARID5AQ03989 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARID5AQ03989 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARID5AQ03989 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARID5AQ03989 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARID5AQ03989 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARID5AQ03989 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARID5AQ03989 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARID5AQ03989 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARID5AQ03989 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARID5AQ03989 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARID5AQ03989 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARID5AQ03989 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARID5AQ03989 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARID5AQ03989 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARID5AQ03989 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARID5AQ03989 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ARID5AQ03989 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARID5AQ03989 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ARID5AQ03989 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARID5AQ03989 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARID5AQ03989 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ARID5AQ03989 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARID5AQ03989 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARID5AQ03989 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARID5AQ03989 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ARID5AQ03989 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARID5AQ03989 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARID5AQ03989 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARID5AQ03989 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARID5AQ03989 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARID5AQ03989 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ARID5AQ03989 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ARID5AQ03989 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ARID5AQ03989 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARID5AQ03989 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARID5AQ03989 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARID5AQ03989 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ARID5AQ03989 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARID5AQ03989 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARID5AQ03989 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARID5AQ03989 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARID5AQ03989 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARID5AQ03989 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARID5AQ03989 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARID5AQ03989 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARID5AQ03989 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARID5AQ03989 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARID5AQ03989 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARID5AQ03989 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARID5AQ03989 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARID5AQ03989 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARID5AQ03989 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ARID5AQ03989 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ARID5AQ03989 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ARID5AQ03989 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
ARID5AQ03989 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ARID5AQ03989 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms