Protein–RNA interactions for Protein: P80162

CXCL6, C-X-C motif chemokine 6, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL6P80162 TVP23A-201ENST00000299866 3360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
CXCL6P80162 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
CXCL6P80162 STAT3-203ENST00000404395 2633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
CXCL6P80162 LINC00442-202ENST00000456737 2063 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
CXCL6P80162 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
CXCL6P80162 AC022497.1-201ENST00000624916 3691 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
CXCL6P80162 DTX1-201ENST00000257600 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
CXCL6P80162 RALGPS1-201ENST00000259351 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
CXCL6P80162 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
CXCL6P80162 C12orf76-205ENST00000548191 2204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
CXCL6P80162 CTTN-201ENST00000301843 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
CXCL6P80162 SETD1B-204ENST00000619791 5901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
CXCL6P80162 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
CXCL6P80162 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
CXCL6P80162 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
CXCL6P80162 DCAF4-203ENST00000394234 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
CXCL6P80162 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
CXCL6P80162 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
CXCL6P80162 RAB3IP-212ENST00000550536 9646 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
CXCL6P80162 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
CXCL6P80162 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
CXCL6P80162 ELOVL4-201ENST00000369816 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
CXCL6P80162 PPP1R8-202ENST00000311772 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
CXCL6P80162 DNMT3B-206ENST00000456297 2315 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
CXCL6P80162 PCDHGA12-201ENST00000252085 4747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
CXCL6P80162 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
CXCL6P80162 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
CXCL6P80162 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
CXCL6P80162 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
CXCL6P80162 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC8.85□□□□□ -0.99
CXCL6P80162 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
CXCL6P80162 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
CXCL6P80162 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
CXCL6P80162 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
CXCL6P80162 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
CXCL6P80162 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
CXCL6P80162 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
CXCL6P80162 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
CXCL6P80162 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
CXCL6P80162 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
CXCL6P80162 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
CXCL6P80162 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
CXCL6P80162 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
CXCL6P80162 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
CXCL6P80162 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
CXCL6P80162 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
CXCL6P80162 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
CXCL6P80162 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
CXCL6P80162 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
CXCL6P80162 KCNMA1-232ENST00000638306 3811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
CXCL6P80162 AC005695.1-201ENST00000574307 5672 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
CXCL6P80162 MYO1D-202ENST00000394649 5451 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
CXCL6P80162 ZNF197-204ENST00000383745 2935 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
CXCL6P80162 DLEC1-201ENST00000308059 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
CXCL6P80162 PAPLN-203ENST00000554301 4090 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
CXCL6P80162 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
CXCL6P80162 SEZ6L-201ENST00000248933 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
CXCL6P80162 SEZ6L-210ENST00000629590 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
CXCL6P80162 NR1H3-217ENST00000467728 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
CXCL6P80162 SMC6-201ENST00000351948 5173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
CXCL6P80162 GBP1P1-201ENST00000394662 1740 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
CXCL6P80162 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
CXCL6P80162 EGFLAM-204ENST00000397202 2398 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
CXCL6P80162 AGAP12P-201ENST00000585227 2359 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
CXCL6P80162 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
CXCL6P80162 ANXA11-201ENST00000265447 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
CXCL6P80162 OTOF-204ENST00000402415 5108 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
CXCL6P80162 SCN8A-209ENST00000627620 5943 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
CXCL6P80162 CYTH1-203ENST00000585509 3315 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
CXCL6P80162 IL2RG-203ENST00000374202 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
CXCL6P80162 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
CXCL6P80162 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
CXCL6P80162 MEGF8-202ENST00000334370 10966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
CXCL6P80162 IKBKE-201ENST00000578328 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
CXCL6P80162 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
CXCL6P80162 PPP1R11-204ENST00000376769 1689 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
CXCL6P80162 AGAP2-203ENST00000547588 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
CXCL6P80162 WASHC1-201ENST00000442898 1827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
CXCL6P80162 POTEB3-201ENST00000611217 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
CXCL6P80162 PRKD1-201ENST00000331968 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
CXCL6P80162 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
CXCL6P80162 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
CXCL6P80162 NEDD4L-208ENST00000456173 4978 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
CXCL6P80162 HDLBP-214ENST00000427183 6238 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
CXCL6P80162 BRWD1-204ENST00000380800 7605 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
CXCL6P80162 DGCR2-206ENST00000545799 4484 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
CXCL6P80162 CTDP1-202ENST00000299543 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
CXCL6P80162 ESRRB-201ENST00000380887 2745 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
CXCL6P80162 PRKCE-201ENST00000306156 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
CXCL6P80162 ZMYND10-201ENST00000231749 2896 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
CXCL6P80162 CASS4-202ENST00000434344 2888 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
CXCL6P80162 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
CXCL6P80162 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
CXCL6P80162 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
CXCL6P80162 PDE2A-218ENST00000540345 3027 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
CXCL6P80162 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
CXCL6P80162 SECISBP2-201ENST00000339901 3320 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
CXCL6P80162 PPP3CA-202ENST00000394853 3604 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
CXCL6P80162 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
CXCL6P80162 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms