Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 SP3-201ENST00000310015 6359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 MEAF6-204ENST00000373075 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 CBLB-204ENST00000405772 3237 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 TCF3-202ENST00000344749 4289 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 PELP1-201ENST00000301396 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 WASF3-201ENST00000335327 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 MYO10-210ENST00000513610 8038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 MATN1-AS1-201ENST00000414532 3925 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 HDGFL3-201ENST00000299633 12733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC10.43□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 HDAC7-202ENST00000354334 4065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 HDAC7-201ENST00000080059 4095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 RBM8A-204ENST00000583313 4961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 C19orf12-208ENST00000614091 4489 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.43□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 TACC2-229ENST00000515603 9101 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 MADD-207ENST00000402799 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 KANSL1-208ENST00000574590 5147 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 RRBP1-202ENST00000360807 3727 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 SEPT9-201ENST00000329047 4453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 RNF130-207ENST00000522208 9945 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 PCDHAC1-201ENST00000253807 5299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 NPR3-201ENST00000265074 7344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 AC068075.1-201ENST00000519714 1832 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 MKX-201ENST00000375790 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 MEST-206ENST00000416162 2158 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 AP001999.1-201ENST00000513405 3684 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 DNAJB12-201ENST00000338820 4360 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
HERVK_113P61574 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms