Protein–RNA interactions for Protein: P49459

UBE2A, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 A, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2AP49459 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 GMEB2-203ENST00000370077 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 STARD8-203ENST00000374599 4841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 KLHL8-201ENST00000273963 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 PAAF1-201ENST00000310571 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 AC099489.1-203ENST00000598234 10568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC9.47□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC9.47□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 NAV1-203ENST00000367302 9685 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 TBL1X-206ENST00000424279 5451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 EBF2-203ENST00000520164 5145 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 ZFC3H1-201ENST00000378743 7285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 ARHGAP20-202ENST00000524756 6180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 RGS12-202ENST00000338806 3010 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 DNAJC3-202ENST00000602402 5591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 PWWP2A-202ENST00000456329 3991 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 MYRF-201ENST00000265460 5745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 HDLBP-204ENST00000391976 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 PRKAB2-201ENST00000254101 5417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 FAM225B-201ENST00000423546 5629 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 CHST6-201ENST00000332272 7957 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC9.46□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 PLEKHG3-201ENST00000247226 10351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
UBE2AP49459 TBCD-201ENST00000355528 7168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.6 ms