Protein–RNA interactions for Protein: P40313

CTRL, Chymotrypsin-like protease CTRL-1, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTRLP40313 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CTRLP40313 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CTRLP40313 TMEM229B-207ENST00000557006 3941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CTRLP40313 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CTRLP40313 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CTRLP40313 MAP2K4P1-202ENST00000602584 2539 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CTRLP40313 KCNMA1-232ENST00000638306 3811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CTRLP40313 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CTRLP40313 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CTRLP40313 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CTRLP40313 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CTRLP40313 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CTRLP40313 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CTRLP40313 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CTRLP40313 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CTRLP40313 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CTRLP40313 SLC26A6-205ENST00000395550 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CTRLP40313 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CTRLP40313 YY1AP1-208ENST00000361831 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CTRLP40313 AC102953.2-201ENST00000609755 3026 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
CTRLP40313 SERBP1-204ENST00000370995 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CTRLP40313 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CTRLP40313 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CTRLP40313 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CTRLP40313 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CTRLP40313 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CTRLP40313 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CTRLP40313 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CTRLP40313 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CTRLP40313 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CTRLP40313 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CTRLP40313 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CTRLP40313 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CTRLP40313 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CTRLP40313 TMEM100-201ENST00000424486 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CTRLP40313 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CTRLP40313 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CTRLP40313 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CTRLP40313 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CTRLP40313 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CTRLP40313 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
CTRLP40313 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CTRLP40313 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CTRLP40313 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
CTRLP40313 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CTRLP40313 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CTRLP40313 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
CTRLP40313 SLC1A2-208ENST00000606205 1890 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CTRLP40313 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
CTRLP40313 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
CTRLP40313 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CTRLP40313 TMC5-204ENST00000541464 3581 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CTRLP40313 FLAD1-207ENST00000368433 2656 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CTRLP40313 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CTRLP40313 CCND3-215ENST00000511642 2394 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CTRLP40313 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CTRLP40313 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CTRLP40313 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CTRLP40313 KAZN-205ENST00000400798 3643 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CTRLP40313 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
CTRLP40313 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CTRLP40313 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CTRLP40313 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CTRLP40313 H3F3B-201ENST00000254810 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CTRLP40313 COPS7B-203ENST00000373608 2563 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CTRLP40313 AL031719.1-201ENST00000623365 2587 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
CTRLP40313 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
CTRLP40313 SUPT7L-203ENST00000405491 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CTRLP40313 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CTRLP40313 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CTRLP40313 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CTRLP40313 ZFYVE27-201ENST00000337540 2927 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CTRLP40313 BCAS3-221ENST00000588874 2948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CTRLP40313 INTS3-204ENST00000435409 3597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CTRLP40313 HERC3-203ENST00000407637 2634 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CTRLP40313 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CTRLP40313 FAM200A-202ENST00000449309 2480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CTRLP40313 FCHSD1-209ENST00000522783 2477 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
CTRLP40313 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
CTRLP40313 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CTRLP40313 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
CTRLP40313 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CTRLP40313 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CTRLP40313 POLDIP3-209ENST00000617178 2006 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CTRLP40313 CALB1-201ENST00000265431 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CTRLP40313 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
CTRLP40313 LOXL4-201ENST00000260702 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CTRLP40313 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CTRLP40313 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CTRLP40313 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CTRLP40313 TRAF3IP3-204ENST00000367026 2058 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CTRLP40313 CCDC13-201ENST00000310232 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CTRLP40313 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CTRLP40313 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CTRLP40313 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CTRLP40313 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
CTRLP40313 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CTRLP40313 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CTRLP40313 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
CTRLP40313 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms