Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GGCXP38435 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GGCXP38435 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GGCXP38435 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GGCXP38435 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GGCXP38435 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GGCXP38435 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GGCXP38435 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GGCXP38435 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GGCXP38435 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GGCXP38435 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GGCXP38435 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GGCXP38435 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GGCXP38435 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GGCXP38435 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GGCXP38435 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GGCXP38435 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GGCXP38435 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GGCXP38435 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GGCXP38435 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GGCXP38435 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GGCXP38435 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GGCXP38435 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GGCXP38435 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GGCXP38435 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GGCXP38435 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GGCXP38435 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GGCXP38435 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GGCXP38435 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GGCXP38435 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GGCXP38435 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GGCXP38435 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GGCXP38435 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GGCXP38435 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GGCXP38435 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GGCXP38435 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GGCXP38435 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GGCXP38435 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GGCXP38435 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GGCXP38435 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GGCXP38435 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GGCXP38435 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GGCXP38435 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GGCXP38435 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GGCXP38435 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GGCXP38435 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GGCXP38435 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GGCXP38435 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GGCXP38435 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GGCXP38435 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GGCXP38435 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GGCXP38435 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GGCXP38435 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GGCXP38435 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GGCXP38435 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GGCXP38435 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GGCXP38435 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GGCXP38435 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GGCXP38435 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GGCXP38435 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GGCXP38435 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GGCXP38435 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GGCXP38435 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GGCXP38435 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GGCXP38435 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GGCXP38435 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GGCXP38435 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GGCXP38435 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GGCXP38435 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GGCXP38435 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GGCXP38435 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GGCXP38435 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GGCXP38435 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GGCXP38435 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GGCXP38435 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GGCXP38435 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GGCXP38435 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GGCXP38435 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GGCXP38435 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GGCXP38435 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GGCXP38435 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GGCXP38435 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GGCXP38435 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GGCXP38435 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GGCXP38435 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GGCXP38435 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GGCXP38435 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GGCXP38435 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GGCXP38435 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GGCXP38435 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GGCXP38435 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GGCXP38435 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GGCXP38435 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GGCXP38435 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GGCXP38435 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GGCXP38435 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GGCXP38435 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GGCXP38435 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GGCXP38435 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GGCXP38435 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.6 ms