Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.5 ms