Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PTPRDP23468 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
PTPRDP23468 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PTPRDP23468 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTPRDP23468 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTPRDP23468 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTPRDP23468 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PTPRDP23468 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PTPRDP23468 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PTPRDP23468 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PTPRDP23468 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PTPRDP23468 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PTPRDP23468 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PTPRDP23468 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTPRDP23468 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PTPRDP23468 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTPRDP23468 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTPRDP23468 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTPRDP23468 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PTPRDP23468 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PTPRDP23468 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PTPRDP23468 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTPRDP23468 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PTPRDP23468 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTPRDP23468 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PTPRDP23468 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PTPRDP23468 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTPRDP23468 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTPRDP23468 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PTPRDP23468 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTPRDP23468 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTPRDP23468 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
PTPRDP23468 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTPRDP23468 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTPRDP23468 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTPRDP23468 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PTPRDP23468 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PTPRDP23468 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PTPRDP23468 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PTPRDP23468 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PTPRDP23468 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTPRDP23468 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PTPRDP23468 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTPRDP23468 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PTPRDP23468 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTPRDP23468 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTPRDP23468 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTPRDP23468 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTPRDP23468 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PTPRDP23468 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTPRDP23468 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTPRDP23468 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTPRDP23468 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PTPRDP23468 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTPRDP23468 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTPRDP23468 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PTPRDP23468 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTPRDP23468 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTPRDP23468 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTPRDP23468 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PTPRDP23468 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PTPRDP23468 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PTPRDP23468 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTPRDP23468 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTPRDP23468 EEF1DP2-201ENST00000433698 843 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PTPRDP23468 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PTPRDP23468 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC15.07■□□□□ 0
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PTPRDP23468 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PTPRDP23468 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PTPRDP23468 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTPRDP23468 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PTPRDP23468 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTPRDP23468 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PTPRDP23468 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PTPRDP23468 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PTPRDP23468 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PTPRDP23468 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PTPRDP23468 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTPRDP23468 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PTPRDP23468 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTPRDP23468 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PTPRDP23468 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTPRDP23468 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTPRDP23468 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
PTPRDP23468 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PTPRDP23468 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTPRDP23468 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PTPRDP23468 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PTPRDP23468 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTPRDP23468 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTPRDP23468 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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