Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

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Length 223 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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CTLA4P16410 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CTLA4P16410 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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