Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 DGKD-201ENST00000264057 6297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 CNTN2-201ENST00000331830 7999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 WDFY1-201ENST00000233055 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 SF3A1-201ENST00000215793 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC12.82□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC12.82□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 HIPK3-202ENST00000379016 7345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 LAMB1-201ENST00000222399 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 DUOX2-205ENST00000603300 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.82□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 SOAT1-204ENST00000540564 6861 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 ABCC6-201ENST00000205557 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 NAPEPLD-201ENST00000341533 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 LRRC8C-201ENST00000370454 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 KSR1-204ENST00000398988 7237 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 SIX4-201ENST00000216513 6285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 YTHDF3-209ENST00000617200 5076 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 POU2F2-202ENST00000389341 6901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 CTR9-201ENST00000361367 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms