Protein–RNA interactions for Protein: P0DME0

SETSIP, Protein SETSIP, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETSIPP0DME0 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SETSIPP0DME0 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SETSIPP0DME0 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SETSIPP0DME0 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SETSIPP0DME0 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SETSIPP0DME0 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SETSIPP0DME0 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SETSIPP0DME0 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SETSIPP0DME0 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SETSIPP0DME0 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SETSIPP0DME0 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SETSIPP0DME0 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SETSIPP0DME0 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SETSIPP0DME0 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SETSIPP0DME0 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SETSIPP0DME0 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SETSIPP0DME0 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SETSIPP0DME0 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SETSIPP0DME0 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SETSIPP0DME0 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SETSIPP0DME0 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SETSIPP0DME0 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SETSIPP0DME0 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SETSIPP0DME0 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SETSIPP0DME0 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SETSIPP0DME0 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SETSIPP0DME0 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SETSIPP0DME0 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SETSIPP0DME0 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SETSIPP0DME0 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SETSIPP0DME0 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SETSIPP0DME0 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SETSIPP0DME0 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SETSIPP0DME0 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SETSIPP0DME0 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SETSIPP0DME0 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SETSIPP0DME0 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SETSIPP0DME0 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SETSIPP0DME0 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SETSIPP0DME0 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SETSIPP0DME0 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SETSIPP0DME0 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SETSIPP0DME0 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SETSIPP0DME0 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SETSIPP0DME0 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SETSIPP0DME0 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SETSIPP0DME0 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SETSIPP0DME0 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SETSIPP0DME0 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SETSIPP0DME0 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SETSIPP0DME0 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SETSIPP0DME0 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SETSIPP0DME0 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SETSIPP0DME0 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SETSIPP0DME0 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SETSIPP0DME0 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SETSIPP0DME0 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SETSIPP0DME0 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SETSIPP0DME0 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SETSIPP0DME0 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SETSIPP0DME0 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SETSIPP0DME0 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SETSIPP0DME0 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SETSIPP0DME0 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SETSIPP0DME0 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SETSIPP0DME0 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SETSIPP0DME0 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SETSIPP0DME0 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SETSIPP0DME0 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SETSIPP0DME0 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SETSIPP0DME0 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SETSIPP0DME0 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SETSIPP0DME0 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SETSIPP0DME0 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SETSIPP0DME0 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SETSIPP0DME0 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SETSIPP0DME0 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SETSIPP0DME0 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SETSIPP0DME0 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SETSIPP0DME0 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SETSIPP0DME0 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SETSIPP0DME0 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SETSIPP0DME0 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SETSIPP0DME0 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SETSIPP0DME0 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SETSIPP0DME0 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SETSIPP0DME0 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SETSIPP0DME0 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SETSIPP0DME0 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SETSIPP0DME0 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SETSIPP0DME0 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SETSIPP0DME0 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SETSIPP0DME0 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SETSIPP0DME0 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SETSIPP0DME0 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SETSIPP0DME0 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SETSIPP0DME0 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SETSIPP0DME0 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SETSIPP0DME0 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SETSIPP0DME0 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms